El uso de la firma electrónica en SIGES tiene como finalidad automatizar procesos en la emisión de documentos internos. Para firmar electrónicamente es necesario obtener un certificado digital emitido por el Ministerio de Educación (MINED), con ello, cada usuario correspondiente, obtendrá su propio certificado digital. Entre algunos ejemplos de documentos que se podrán firmar están: La confirmación de matrícula (por parte del director o directora de una sede educativa), confirmación de cierre de secciones y año lectivo, el acta de notas o calificaciones de períodos, notas institucionales y finales (por parte del docente a cargo), promociones, solicitudes y aceptaciones de traslados de estudiantes, entre otros.